Berdasarkan data hasil verifikasi administrasi yang telah dilakukan oleh tim asistensi assessment Liga Profesional PSSI, disimpulkan hal hal sebagai berikut :
1. Tidak ada satupun klub yang mampu memenuhi seluruh persyaratan klub profesional sesuai dengan standar Liga Champions Asia.
2. Lebih dari 10 klub profesional dari musim lalu (ISL) tidak memiliki laporan keuangan yang telah diaudit.
3. Klub yang telah menyerahkan deposit partisipasi atau bank garansi kepada PSSI berasal bukan dari level ISL dan Divisi Utama klasemen terakhir, tetapi dari Divisi di bawah.
4. Selanjutnya Komite Kompetisi PSSI memutuskan membagi Kompetisi Profesional ke dalam dua strata:
A. Kompetisi Liga Profesional Level
Liga Profesional level 1 akan dibagi dalam 2 grup, dengan masing-masing grup berisi 16 klub. Total peserta 32 klub.
B. Kompetisi Liga Profesional Level 2
a) Liga profesional level 2 akan dibagi dalam 4 grup, masing-masing 12 klub. Total peserta 48 klub.
b) Karena level 2 masih butuh 10 klub tambahan dan memenuhi kuota tersebut, maka PSSI masih membuka kesempatan kepada 10 klub dari divisi 1 di luar klasemen musim lalu untuk ikut pada kompetisi level 2. Dengan catatan klub tersebut dapat memuni syarat yang telah diwajibkan (berbadan hukum PT).
Berikut 34 klub calon peserta kompetisi Liga Profesional level 1:
1. Persipura Jayapura
2. Arema
3. Persija Jakarta
4. Semen Padang
5. Sriwijaya FC
6. Persisam Samarinda
7. Persib Bandung
8. Persiwa Wamena
9. Persela Lamongan
10. Persiba Balikpapan
11. PSPS Pekanbaru
12. Pelita Jaya
13. Deltras Sidoarjo
14. Persijap Jepara
15. Bontang FC
16. Persema Malang
17. Persibo Bojonegoro
18. PSM Makassar
19. Mitra Kukar
20. Persiraja Banda Aceh
21. PSMS Medan
22. Pro Duta FC
23. Persik Kediri
24. PSIS Semarang
25. PSCS Cilacap
26. Persikota Tangerang
27. Persis Solo
28. Persiba Bantul
29. Persebaya Surabaya
30. PS Barito Putra
31. PSS Sleman
32. PSIR Rembang
33. PS Bengkulu
34. Persipasi Bekasi
** Bagi klub Arema, Persebaya dan Persija akan ditunggu penyelesaian masalah internalnya dan PSSI akan mengundang para pihak yang terkait dengan klub.
Liga Profesional level 2 akan diikuti 48 klub peserta. Sebanyak 2 klub dari level 1 yang tidak lolos kelaikan stadion, 36 dinominasikan dari klub yang sudah mendaftar dan akan diverifikasi lagi 10 klub dari Divisi 1 di luar klasemen musim lalu untuk ikut pada kompetisi level 2. Dengan catatan klub tersebut dapat memenuhi syarat yang telah diwajibkan (berbadan hukum PT) sebelum akhir musim kompetisi 2011/2012.
Berikut 36 klub yang dinominasikan mengikuti kompetisi Liga Profesional level 2:
1. PSAP Sigli
2. Persita Tangerang
2. Persih Tembilahan
4. Persitara
5. Persikabo
6. PSLS Lhoksuemawe
7. PSSB Bireun.
8. Persires Rengat
9. Persiram Rajam Ampat
10. Gresik United
11. Perseman Manokwari
12. PSIM Yogyakarta
13. Persikab Bandung
14. Persemalra Tual
15. PPSM Magelang
16. Persidafon Dafonsoro
17. PSBI Blitar
18. Persigo Gorontalo
19. Persiku Kudus
20. Persipro Probolinggo
21. Perseru Serui
22. PSMP Mojokerto
23. PSBS Biak
24. Persbul Buol
25. Persepam Pamekasan
26. PSBL Langsa
27. Perssin Sinjai
28. Madiun Putra
29. Persewangi Banyuwangi
30. Persip Kota Pekalongan
31. PSBK Blitar
32. PSGL Gayo Lues
33. KSB Sumbawa Barat
34. Persitema Temanggung
35. Persid Jember
36. Persepar Palangkaraya